Naupactus minor pertenece al grupo de especies de N. leucoloma, revisado por Lanteri & Marvaldi (1995). Se diferencia de esta especie principalmente por su tamaño más pequeño, las setas del pronoto y élitros más cortas, y las corbículas de las tibias posteriores presentes, aunque estrechas. Se distingue de N. peregrinus porque los ojos son más aplanados y las setas del pronoto están dirigidas hacia adelante y no hacia atrás.
i]Naupactus minor es partenogenética y está infectada por la bacteria Wolbachia, que induce partenogénesis en varias especies de Naupactini (Rodriguero et al. 2010a). Su distribución potencial fue estimada por técnicas de modelado de nicho ecológico (Lanteri et al. 2013b).
Causa daños en alfalfa (Medicago sativa L.), Lotus spp y soja (Glycine max L. (Merr.)) en Argentina, Brasil y Uruguay (Lanteri 1994, Alzugaray et al. 1998, Lanteri et al. 2002a, 2013a b).
Naupactus minor está asociada con pastizales de la provincia biogeográfica Pampeana.